第一师阿拉尔市党委党校（行政学院、三五九旅干部学院）是师市党委的重要工作部门，是培训党的各级领导干部的主渠道，是党的思想理论建设的重要阵地。第一师阿拉尔市党委党校（行政学院、三五九旅干部学院）实行校（院）务委员会领导体制，下设综合办公室、教学培训部、科研办（决策咨询办、信息管理部）、哲学社会科学教研室、党史党建教研室、经济管理教研室、文史教研室、统战理论教研室（民族宗教学教研室）、公共管理教研室、法学教研室。
第一师阿拉尔市党委党校（行政学院、三五九旅干部学院）始建于1960年5月，前身是中国人民解放军二军五师干训队。1965年3月，曾一度改称干部政治学校并迁到阿拉尔，与师参谋训练队合并成立师教导大队。1984年12月5日，经兵团党委批准，同意恢复了党校。2005年4月，“行政学校”在师党委党校成立。2014年11月10日，经兵团党委组织部、编办批准成立三五九旅干部学院，形成“三校合一”的管理体制。坚守“为党育才，为党献策”的初心，遵循“党校姓党、实事求是、质量立校、改革创新、从严治校”原则，形成具有自身特色的培训模式，充分发挥党性党风党纪教育的主阵地、主渠道作用。